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How to make good resolutions

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Multi angle
Auteurs : Véber, Amandine (Auteur de la Conférence)
CIRM (Editeur )

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Résumé : In this presentation, we shall discuss the reconstruction of demographic parameters based on the genetic variability observed within a sample of individual DNA. In the family of models that we consider, the statistics describing this genetic diversity (number of mutations, distribution of the mutations amongst individuals in the sample) depend on a more or less coarse ‘resolution of (i.e., level of information on) the hidden genealogical tree that relates the sampled individuals. Considering the optimal resolution thus allows to greatly improve the exploration of the space of possible genealogies when computing the likelihood of demographic parameters, compared to classical methods based on full labelled trees such as Kingmans coalescent. We shall focus on two examples, based on works with Raazesh Sainudiin (Uppsala Univ.) and with Julia Palacios (Stanford Univ.), Sohini Ramachandran (Brown Univ.) and John Wakeley (Harvard Univ.).

Codes MSC :
60J10 - Markov chains (discrete-time Markov processes on discrete state spaces)
60J27 - Continuous-time Markov processes on discrete state spaces
92D15 - Problems related to evolution
92D20 - Protein sequences, DNA sequences

    Informations sur la Vidéo

    Langue : Anglais
    Date de publication : 28/06/2018
    Date de captation : 28/06/2018
    Sous collection : Research talks
    arXiv category : Probability
    Domaine : Mathematics in Science & Technology ; Probability & Statistics
    Format : MP4 (.mp4) - HD
    Durée : 00:52:26
    Audience : Researchers
    Download : https://videos.cirm-math.fr/2018-06-28_Veber.mp4

Informations sur la Rencontre

Nom de la rencontre : Probability and biological evolution / Probabilités et évolution biologique
Organisateurs de la rencontre : Pardoux, Etienne ; Wakolbinger, Anton
Dates : 25/06/2018 - 29/06/2018
Année de la rencontre : 2018
URL Congrès : https://conferences.cirm-math.fr/1774.html

Données de citation

DOI : 10.24350/CIRM.V.19418703
Citer cette vidéo: Véber, Amandine (2018). How to make good resolutions. CIRM. Audiovisual resource. doi:10.24350/CIRM.V.19418703
URI : http://dx.doi.org/10.24350/CIRM.V.19418703

Bibliographie



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