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Documents  92B05 | enregistrements trouvés : 49

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Research talks;Mathematics in Science and Technology;Probability and Statistics

In recent years, new pandemic threats have become more and more frequent (SARS, bird flu, swine flu, Ebola, MERS, nCoV...) and analyses of data from the early spread more and more common and rapid. Particular interest is usually focused on the estimation of $ R_{0}$ and various methods, essentially based estimates of exponential growth rate and generation time distribution, have been proposed. Other parameters, such as fatality rate, are also of interest. In this talk, various sources of bias arising because observations are made in the early phase of spread will be discussed and also possible remedies proposed. In recent years, new pandemic threats have become more and more frequent (SARS, bird flu, swine flu, Ebola, MERS, nCoV...) and analyses of data from the early spread more and more common and rapid. Particular interest is usually focused on the estimation of $ R_{0}$ and various methods, essentially based estimates of exponential growth rate and generation time distribution, have been proposed. Other parameters, such as fatality rate, are also of ...

92B05 ; 92B15 ; 62P10

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- 275 p.
ISBN 978-0-8218-0756-9

DIMACS series in discrete mathematics and theoretical computer science , 0044

Localisation : Collection 1er étage

biochimie # biologie cellulaire # biomathématique # calcul # dynamique de l'ADN # informatique théorique # modélisation # protéine

68Q05 ; 92-06 ; 92B05 ; 92C40

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- 201 p.
ISBN 978-0-8218-0941-9

Lectures on mathematics in the life sciences , 0026

Localisation : Colloque 1er étage (AIZU)

algorithme # analyse du génome # autonéplicon # bioinformatique # biologie # biologie de l'évolution # complexité biologique # dynamique des popullations # espace euclidien # modèle mathématique # morphogénèse # propriété du code génétique # simulation informatique # symbiologénése

92-02 ; 92-06 ; 92B05 ; 92D15

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- 135 p.
ISBN 978-0-8218-2793-2

Contemporary mathematics , 0284

Localisation : Collection 1er étage

opérateur de Toeplitz # espace Beryman # algèbre ternaire # forme quadratique binaire # système dynamique ergodique # caractérisation spectrale # système cohérent vague # treillis # analyse de données spaciale # quantisation local

01A30 ; 28D05 ; 92B05 ; 92B99 ; 81Q99 ; 03B05 ; 03E72 ; 90B10 ; 47A15 ; 37A30

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- 249 p.
ISBN 978-0-8218-2053-7

DIMACS series in discrete mathematics and theoretical computer science , 0054

Localisation : Collection 1er étage

calcul moléculaire # calcul sur les bases d'ADN # informatique # modèle de calcul # mode calculatoire # biologie # ADN # biomathématique # génétique # bioinformatique # biophysique # combinatoire

68-02 ; 68Q05 ; 68Q10 ; 68M99 ; 92-00 ; 92B05 ; 92B20 ; 92C05

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- 94 p.

Journée annuelle

Localisation : Ouvrage RdC (CLAUDE)

modèlisation des systèmes biologiques # biologie # écologie # génétique #

92-06 ; 92B05

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- 242 p.
ISBN 978-0-8218-3197-7

DIMACS series in discrete mathematics and theorerical computer science , 0061

Localisation : Collection 1er étage

biomathématique # mathématique appliquée à la biologie # arbre # bioconsensus # hypergraphe # ensemble ordonnée # classification # préférence de groupe # science comportementale # taxonomie # biologie moléculaire # évolution

00B25 ; 91F99 ; 92-06 ; 92B10 ; 05C05 ; 05C65 ; 06A99 ; 62H30 ; 92B05 ; 92C40 ; 92D15

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- 284 p.
ISBN 978-3-7643-3435-2

Mathematical modeling , 0004

Localisation : Ouvrage RdC (CAST)

biologie # modélisation # évolution # économie # linguistique

92B05 ; 92-02 ; 91B99 ; 00A71 ; 92F05

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- 151 p.
ISBN 978-0-8218-3964-5

Proceedings of symposia in applied mathematics , 0064

Localisation : Collection 1er étage

bio-mathématiques # génétique # système dynamique # modélisation # simulation

92B05 ; 00B25 ; 92-06 ; 92D10 ; 92D25 ; 92-08

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- xiv; 268 p.
ISBN 978-0-8218-4384-0

DIMACS series in discrete mathematics and theoretical computer science , 0075

Localisation : Collection 1er étage

mathématiques appliquées à la biologie # application médicale

34D05 ; 34D20 ; 34D23 ; 92B05 ; 92-01 ; 92-02 ; 92-06 ; 92D25 ; 92D30

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- vi; 134 p.
ISBN 978-0-8218-4845-6

Fields institute communications , 0057

Localisation : Collection 1er étage

biomathématiques # biologie

92-XX ; 92-06 ; 92B05 ; 92C50 ; 00B25

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- ix; 310 p.
ISBN 978-0-8218-9862-8

Contemporary mathematics , 0618

Localisation : Collection 1er étage

oscillation non linéaire # comportement asymptotique des équations différentielles # discrétisation par différences finies # système dynamique discret # Ronald Mickens

34C15 ; 34D05 ; 34D20 ; 34D23 ; 37M20 ; 92B05 ; 34-06 ; 39A28 ; 39A30 ; 00B25

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- vii; 238 p.
ISBN 978-0-8218-9850-5

Contemporary mathematics , 0628

Localisation : Collection 1er étage

hémodynamique # rhéologie # écoulement de fluide # dynamique des fluides # biophysique # biomathématiques

92-06 ; 00B25 ; 92B05 ; 92C05 ; 92C10 ; 92C35 ; 76Z05 ; 35Q92

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Research talks;Mathematics in Science and Technology

In the second talk, I will present some of our work on this area. Our work on this area, where we have focused on transcriptomics and (phospho)proteomics to study signaling networks. Our tools range from a meta-resource of biological knowledge (Omnipath) to methods to infer pathway and transcription factor activities (PROGENy and DoRothEA, respectively) from gene expression and subsequently infer causal paths among them (CARNIVAL), to tools to infer logic models from phosphoproteomic and phenotypic data (CellNOpt and PHONEMeS). We have recently adapted these tools to single-cell data. I will illustrate their utility in cases of biomedical relevance, in particular to improve our understanding of cancer and to develop novel therapeutic opportunities. As main application I will discuss our work analysing, as a model for personalized medicine, large pharmaco-genomic screenings in cell lines. These screenings provide rich information about alterations in tumours that confer drug sensitivity or resistance. Integration of this data with prior knowledge provides biomarkers and offer hypotheses for novel combination therapies. Our own analysis as well as the results of a crowdsourcing effort (as part of a DREAM
challenge) reveals that prediction of drug efficacy from basal omics data is that discussed above is far from accurate, implying important limitations for personalised medicine. An important aspect that deserves detailed attention is the dynamics of signaling networks and how they response to perturbations such as drug treatment.
I will present how cell-specific logic models, trained with measurements upon perturbations, can provides new biomarkers and treatment opportunities not noticeable by static molecular characterisation.
In the second talk, I will present some of our work on this area. Our work on this area, where we have focused on transcriptomics and (phospho)proteomics to study signaling networks. Our tools range from a meta-resource of biological knowledge (Omnipath) to methods to infer pathway and transcription factor activities (PROGENy and DoRothEA, respectively) from gene expression and subsequently infer causal paths among them (CARNIVAL), to tools to ...

92B05 ; 92-08 ; 92-10 ; 92C42

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Research talks;Mathematics in Science and Technology

Modern technologies allow us to profile in high detail biomedical samples at fast decreasing costs. New technologies are opening new data modalities, in particular to measure at the single cell level. Prior knowledge, and biological networks in particular, are useful to integrate this data and distill mechanistic insight. This can help to interpret the result of machine learning or statistical analysis, as well as generate input features for these methods. In addition, they can be converted in dynamic mechanistic models to gain more specific insight. I will give an overview of these approaches showcasing some examples and approaches used in the field. Modern technologies allow us to profile in high detail biomedical samples at fast decreasing costs. New technologies are opening new data modalities, in particular to measure at the single cell level. Prior knowledge, and biological networks in particular, are useful to integrate this data and distill mechanistic insight. This can help to interpret the result of machine learning or statistical analysis, as well as generate input features for ...

92B05 ; 92-08 ; 92-10 ; 92C42

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- 128 p.
ISBN 978-3-540-07792-3

Lecture notes in biomathematics , 0010

Localisation : Ouvrage RdC (TYSO)

biologie mathématique # onde chimique # réaction # solution périodique # équation différentielle ordinaire

80A32 ; 92B05 ; 92E10 ; 92E20 ; 92Exx

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- 44 p.

Actualités scientifiques et industrielles , 0096

Localisation : Ouvrage RdC (KOST)

biomathématique # parasitisme # symbiose # évolution

92B05

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- 96 p.

Actualités Scientifiques et Industrielles , 0243

Localisation : Ouvrage RdC (VOLT)

association biologique # fluctuation # phénomène héréditaire

92B05 ; 92B15 ; 92D25

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- pag. mult.

Cahiers Scientifiques , 0007

Localisation : Ouvrage RdC (VOLT)

biologie mathématique # coexistence # individus # lutte pour la vie

92B05 ; 92B15 ; 92Bxx ; 92D25 ; 92D50

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- 252 p.
ISBN 978-0-387-97639-6

Texts in applied mathematics , 0010

Localisation : Ouvrage RdC (HOPP)

biogéographie # coeur et circulation # contrôle neuronal # démographie # hérédité # membrane cellulaire # mécanique # mécanisme de contre courant rénal # médecine # science de la vie # volume cellulaire # échange des gaz dans le poumon # épidémie

92-01 ; 92B05 ; 92D99

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